Místo
Název práce anglicky
Prediction of conformation- and sequence-dependent hydration sites in protein structures.
Anotace
- Seznamte se s datovými formáty ve strukturní biologii [1,2] a s principy a nástroji pro práci s nimi [3].
- Seznamte se s konformačně a sekvenčně závislou solvatací proteinů [4].
- Seznamte s C++ knihovnami používanými ve strukturní biologii.
- Vytvořte v C++ sdílenou knihovnu a na ní založený spustitelný CLI program , který zpracuje vstupní mmCIF soubor s modelem biomolekul(y) a s využitím dat z [4] předpoví pravděpodobné polohy vod. Výstupem bude doplněný mmCIF soubor.
- Zvažte úpravy vytvořené C++ knihovny umožňující její použití jako modul v Pythonu 3
Vedoucí práce - externí
Ing. Jiří Černý, Ph.D.
Student